Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP3Q9H9T3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ELP3Q9H9T3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ELP3Q9H9T3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ELP3Q9H9T3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms