Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIL1Q9H173 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SIL1Q9H173 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms