Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCSER1Q9C0I3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms