Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms