Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NLRP1Q9C000 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP1Q9C000 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms