Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM8Q9BZR9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM8Q9BZR9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms