Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms