Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOL6Q9BWW8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms