Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms