Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms