Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA3Q9BQP9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms