Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms