Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDRT15Q96T59 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDRT15Q96T59 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms