Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TEFMQ96QE5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TEFMQ96QE5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms