Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CIB3Q96Q77 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms