Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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