Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRERF1Q96PN7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms