Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms