Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms