Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCC12Q96J65 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms