Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF25Q93038 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF25Q93038 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms