Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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RABGGTAQ92696 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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RABGGTAQ92696 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RABGGTAQ92696 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RABGGTAQ92696 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RABGGTAQ92696 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RABGGTAQ92696 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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RABGGTAQ92696 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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RABGGTAQ92696 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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RABGGTAQ92696 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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RABGGTAQ92696 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGGTAQ92696 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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