Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM41Q8WV44 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms