Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HELQQ8TDG4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HELQQ8TDG4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms