Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms