Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC191Q8NCU4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC191Q8NCU4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms