Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD53Q8N9V6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms