Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME8Q8N427 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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