Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms