Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS6Q7L5N1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS6Q7L5N1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms