Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC129Q6ZRS4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms