Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC174Q6PII3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC174Q6PII3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms