Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms