Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms