Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf53Q5VUE5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms