Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT03

NUTM2D, NUT family member 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUTM2DQ5VT03 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NUTM2DQ5VT03 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NUTM2DQ5VT03 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms