Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q5VSD8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q5VSD8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q5VSD8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q5VSD8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q5VSD8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q5VSD8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q5VSD8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q5VSD8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms