Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOGA3Q5TF21 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms