Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP70Q5T0N1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP70Q5T0N1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms