Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms