Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRDTQ58F21 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRDTQ58F21 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms