Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACSM3Q53FZ2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms