Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms