Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC96Q2M329 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms