Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms