Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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