Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMA4Q16363 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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