Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCBQ16143 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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