Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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