Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKIV2LQ15477 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms